Análisis Metagenómicos

Análisis Metagenómicos

Análisis Metagenómicos

La metagenómica permite la caracterización y cuantificación de las comunidades microbianas presentes en una muestra. Esta información tiene múltiples aplicaciones clínicas, biotecnológicas y medioambiantales. 

 

A partir de datos procedentes de secuenciación de regiones variables 16S o shotgun llevamos a cabo análisis metagenómicos que incluyen:

 

  • Filtrado de datos y controles estadísticos de calidad de las secuencias.
  • Anotación basada en asignación de OTUs (Operational Taxonomic Unit).
  • Cálculo de la alfa y beta diversidad.
  • Clasificación taxonómica y análisis diferencial.
  • Predicción de la contribución en rutas biológicas y metabólicas.

Visualización de resultados

Los resultados se entregan a través de nuestra plataforma web Genome one Reports en la que podrás llevar a cabo su visualización y revisión.

 

Toda la información se representa en tablas interactivas y gráficos fácilmente interpretables y exportables en formatos adecuados para su uso en publicaciones científicas.

 

A través de Genome one Reports tendrás acceso a los datos de:

 

  • Análisis de calidad de las secuencias obtenidas.
  • Análisis de alfa diversidad:
    • OTUs
    • Shannon Index
    • Faith’s Phylgenetic Diversity
  • Análisis de beta diversidad:
    • Bray Curtis Index
    • Jaccard Index
    • UNIFRAC Weighted Index
    • UNIFRAC Unweighted Index
  • Clasificación taxonómica y análisis diferencial:
    • Taxonomic barplots
    • Percentajes
    • Differential analysis
    • Differential analysis plot
  • Predicción del impacto metabólico:
    • Pathway enrichment plot
    • Pathway enrichment table
Ejemplo de visualización de los resultados a través de nuestra plataforma Genome one Reports.

¿Tienes alguna duda?

Estamos a tu completa disposición para resolver cualquier posible duda que tengas.

 

​Puedes enviarnos un mensaje cumplimentado el formulario adjunto o llamarnos al siguiente número de teléfono.