Análisis Metagenómicos
La metagenómica permite la caracterización y cuantificación de las comunidades microbianas presentes en una muestra. Su implicación, tanto en la aparición y evolución de algunas enfermedades como el papel que puede jugar en la diferente respuesta de los pacientes a un mismo tratamiento, está atrayendo enormemente el interés de la comunidad científica en la actualidad.
A partir de datos procedentes de secuenciación de regiones variables 16S (tecnologías Illumina o Ion Torrent) llevamos a cabo análisis metagenómicos que incluyen:
- Filtrado de datos y controles estadísticos de calidad de las secuencias.
- Anotación basada en asignación de OTUs (Operational Taxonomic Unit).
- Cálculo de la alfa y beta diversidad.
- Clasificación taxonómica y análisis diferencial.
- Predicción de la contribución en rutas biológicas y metabólicas.
Visualización de Resultados
El informe de resultados se entrega a través de nuestra plataforma web Genome one Reports para que puedas llevar a cabo la visualización y revisión de los mismos. Toda la información se representa en tablas interactivas y gráficos fácilmente interpretables y exportables en formatos adecuados para su uso en publicaciones científicas.
A través de Genome one Reports tendrás acceso a:
- Análisis de calidad de las secuencias obtenidas.
- Análisis de alfa diversidad (OTUs, Shannon Index, Faith’s Phylgenetic Diversity).
- Análisis de beta diversidad (Bray Curtis Index, Jaccard Index, UNIFRAC Weighted Index, UNIFRAC Unweighted Index).
- Clasificación taxonómica y análisis diferencial (taxonomic barplots, percentajes, differential analysis, differential analysis plot).
- Predicción del impacto metabólico (pathway enrichment plot and pathway enrichment table).
Ejemplo de visualización de los resultados a través de nuestra plataforma Genome one Reports.
Metagenómica y diferente respuesta terapéutica
Se ha demostrado que algunos microorganismos pueden influir en el metabolismo de los fármacos orales, tanto en la absorción como en la biodisponibilidad, pero también en el de los fármacos administrados por vía intravenosa, modulando la expresión de genes que actúan sobre el metabolismo hepático de éstos.
Metagenómica y diferente respuesta terapéutica
Se ha demostrado que algunos microorganismos pueden influir en el metabolismo de los fármacos orales, tanto en la absorción como en la biodisponibilidad, pero también en el de los fármacos administrados por vía intravenosa, modulando la expresión de genes que actúan sobre el metabolismo hepático de éstos.
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