La metagenómica permite la caracterización y cuantificación de las comunidades microbianas presentes en una muestra. Su implicación, tanto en la aparición y evolución de algunas enfermedades como el papel que puede jugar en la diferente respuesta de los pacientes a un mismo tratamiento, está atrayendo enormemente el interés de la comunidad científica en la actualidad.
A partir de datos procedentes de secuenciación de regiones variables 16S (tecnologías Illumina o Ion Torrent) llevamos a cabo análisis metagenómicos que incluyen: