Análisis Metagenómicos
Análisis Metagenómicos
La metagenómica permite la caracterización y cuantificación de las comunidades microbianas presentes en una muestra. Esta información tiene múltiples aplicaciones clínicas, biotecnológicas y medioambiantales.
A partir de datos procedentes de secuenciación de regiones variables 16S o shotgun llevamos a cabo análisis metagenómicos que incluyen:
- Filtrado de datos y controles estadísticos de calidad de las secuencias.
- Anotación basada en asignación de OTUs (Operational Taxonomic Unit).
- Cálculo de la alfa y beta diversidad.
- Clasificación taxonómica y análisis diferencial.
- Predicción de la contribución en rutas biológicas y metabólicas.
Información adicional
Visualización de resultados
Los resultados se entregan a través de nuestra plataforma web Genome one Reports en la que podrás llevar a cabo su visualización y revisión.
Toda la información se representa en tablas interactivas y gráficos fácilmente interpretables y exportables en formatos adecuados para su uso en publicaciones científicas.
A través de Genome one Reports tendrás acceso a los datos de:
- Análisis de calidad de las secuencias obtenidas.
- Análisis de alfa diversidad:
- OTUs
- Shannon Index
- Faith’s Phylgenetic Diversity
- Análisis de beta diversidad:
- Bray Curtis Index
- Jaccard Index
- UNIFRAC Weighted Index
- UNIFRAC Unweighted Index
- Clasificación taxonómica y análisis diferencial:
- Taxonomic barplots
- Percentajes
- Differential analysis
- Differential analysis plot
- Predicción del impacto metabólico:
- Pathway enrichment plot
- Pathway enrichment table
Ejemplo de visualización de los resultados a través de nuestra plataforma Genome one Reports.
¿Tienes alguna duda?
Estamos a tu completa disposición para resolver cualquier posible duda que tengas.
Puedes enviarnos un mensaje cumplimentado el formulario adjunto o llamarnos al siguiente número de teléfono.