Análisis Transcriptómicos
Análisis Transcriptómicos
Los análisis transcriptómicos permiten cuantificar la expresión génica mediante el uso de plataformas NGS. La interpretación de los datos procedentes de esta tecnología se ha convertido en un servicio cada vez más demandado debido a su sensibilidad y precisión.
En Dreamgenics poseemos una amplia experiencia en el análisis bioinformático de RNA-Seq de múltiples especies.
Nuestro servicio de análisis incluye:
- Control de calidad de las secuencias.
- Ensamblaje de novo (opcional).
- Alineamiento de lecturas frente a secuencias de referencia.
- Cuantificación de la expresión génica de la muestra.
- Análisis de la expresión génica diferencial entre distintas muestras.
- Estudio de enriquecimiento de ontologías génicas y pathways.
- Estudio de isoformas generadas en eventos de splicing alternativo*.
- Análisis de genes de fusión*.
- Detección de variantes de calidad (SNVs e InDels) y filtrado de variantes habituales en la población*.
- Identificación de otros RNAs (smallRNAs y ncRNA)*.
*Cuando el diseño del experimento y la cobertura lo permitan.
Información adicional
Visualización de resultados
Los resultados se entregan a través de nuestra plataforma web Genome one Reports en la que podrás llevar a cabo su visualización y revisión.
Toda la información se representa en tablas interactivas y gráficos fácilmente interpretables y exportables en formatos adecuados para su uso en publicaciones científicas.
A través de Genome one Reports tendrás acceso a los datos de:
- Análisis de calidad de las secuencias obtenidas para cada una de las muestras.
- Análisis de correlación de muestras y estudio diferencial de expresión:
- PCA Plot
- Adjusted p-value histogram
- MA plot
- Volcano Plot
- Heatmap
- Correlation Heatmap
- Enriquecimiento de rutas y términos Gene Ontologies:
- KEGG
- GO-MF
- GO-CC
- GO-BP
Además, te ofrecemos la posibilidad de integrar resultados de diferentes análisis transcriptómicos (mRNAs, miRNAs, lncRNAs, etc).
Ejemplo de visualización de los resultados a través de nuestra plataforma Genome one Reports.
¿Tienes alguna duda?
Estamos a tu completa disposición para resolver cualquier posible duda que tengas.
Puedes enviarnos un mensaje cumplimentado el formulario adjunto o llamarnos al siguiente número de teléfono.