Análisis Transcriptómicos

Análisis Transcriptómicos

Los análisis transcriptómicos permiten cuantificar la expresión génica mediante el uso de plataformas NGS. La interpretación de los datos procedentes de la secuenciación del ARN (RNA-Seq) se ha convertido en un servicio cada vez más demandado debido a su sensibilidad y precisión.

 

Nuestro servicio de análisis incluye:

  • Control de calidad de las secuencias.
  • Alineamiento de lecturas frente a secuencias de referencia.
  • Cuantificación de la expresión génica de la muestra.
  • Análisis de la expresión génica diferencial entre distintas muestras.
  • Estudio de enriquecimiento de ontologías génicas y pathways.
  • Estudio de isoformas generadas en eventos de splicing alternativo*.
  • Detección de variantes de calidad (SNVs e InDels) y filtrado de variantes habituales en la población*.
  • Identificación de otros RNAs (smallRNAs y ncRNA)*.
*Cuando el diseño del experimento y la cobertura lo permitan.

Visualización de Resultados

Los resultados se entregan a través de nuestra plataforma web Genome one Reports. Toda la información se representa en tablas interactivas y gráficos fácilmente interpretables y exportables en formatos adecuados para su uso en publicaciones científicas.

 

A través de Genome one Reports tendrás acceso a:

 

  • Análisis de calidad de las secuencias obtenidas.
  • Análisis de correlación de muestras y estudio diferencial de expresión:
    • PCA Plot
    • Adjusted p-value histogram
    • MA plot
    • Volcano Plot
    • Heatmap
    • Correlation Heatmap
  • Enriquecimiento de rutas y términos Gene Ontologies:
    • WikiPathways
    • GO-MF
    • GO-CC
    • GO-BP

Además, ofrecemos la posibilidad de integrar resultados de diferentes análisis transcriptómicos (mRNAs, miRNAs, lncRNAs, etc).

Ejemplo de visualización de los resultados a través de nuestra plataforma Genome one Reports.

El RNA-Seq será de gran ayuda en clínica

Aunque el análisis de RNA-Seq aún no se está usando de forma sistemática en la práctica clínica los datos procedentes del estudio del transcriptoma en diferentes tejidos pueden facilitar la identificación de variantes, genes, rutas metabólicas y cascadas de señalización implicados en diferentes patologías.

El RNA-Seq será de gran ayuda en la práctica clínica

Aunque el análisis de RNA-Seq aún no se está usando de forma sistemática en la práctica clínica los datos procedentes del estudio del transcriptoma en diferentes tejidos pueden facilitar la identificación de variantes, genes, rutas metabólicas y cascadas de señalización implicados en diferentes patologías.

White Papers

White Paper

Por favor, rellena este formulario y te enviaremos el White Paper elegido a tu bandeja de correo.




* Campo obligatorio.

** Al hacer click en "Enviar a mi email" declaro que he leído y acepto la Política de Privacidad y acepto recibir comunicaciones comerciales en el futuro.

Todos los campos deben estar cumplimentados y el email debe tener un formato correcto.

White Paper

Por favor, rellena este formulario y te enviaremos el White Paper elegido a tu bandeja de correo.




* Campo obligatorio.

** Al hacer click en "Enviar a mi email" declaro que he leído y acepto la Política de Privacidad y acepto recibir comunicaciones comerciales en el futuro.

Todos los campos deben estar cumplimentados y el email debe tener un formato correcto.

White Paper

Por favor, rellena este formulario y te enviaremos el White Paper elegido a tu bandeja de correo.




* Campo obligatorio.

** Al hacer click en "Enviar a mi email" declaro que he leído y acepto la Política de Privacidad y acepto recibir comunicaciones comerciales en el futuro.

Todos los campos deben estar cumplimentados y el email debe tener un formato correcto.

White Paper

Por favor, rellena este formulario y te enviaremos el White Paper elegido a tu bandeja de correo.




* Campo obligatorio.

** Al hacer click en "Enviar a mi email" declaro que he leído y acepto la Política de Privacidad y acepto recibir comunicaciones comerciales en el futuro.

Todos los campos deben estar cumplimentados y el email debe tener un formato correcto.

White Paper

Por favor, rellena este formulario y te enviaremos el White Paper elegido a tu bandeja de correo.




* Campo obligatorio.

** Al hacer click en "Enviar a mi email" declaro que he leído y acepto la Política de Privacidad y acepto recibir comunicaciones comerciales en el futuro.

Todos los campos deben estar cumplimentados y el email debe tener un formato correcto.

White Paper

Por favor, rellena este formulario y te enviaremos el White Paper elegido a tu bandeja de correo.




* Campo obligatorio.

** Al hacer click en "Enviar a mi email" declaro que he leído y acepto la Política de Privacidad y acepto recibir comunicaciones comerciales en el futuro.

Todos los campos deben estar cumplimentados y el email debe tener un formato correcto.

White Paper

Por favor, rellena este formulario y te enviaremos el White Paper elegido a tu bandeja de correo.




* Campo obligatorio.

** Al hacer click en "Enviar a mi email" declaro que he leído y acepto la Política de Privacidad y acepto recibir comunicaciones comerciales en el futuro.

Todos los campos deben estar cumplimentados y el email debe tener un formato correcto.