Análisis Transcriptómicos
Los análisis transcriptómicos permiten cuantificar la expresión génica mediante el uso de plataformas NGS. La interpretación de los datos procedentes de la secuenciación del ARN (RNA-Seq) se ha convertido en un servicio cada vez más demandado debido a su sensibilidad y precisión.
Nuestro servicio de análisis incluye:
- Control de calidad de las secuencias.
- Ensamblaje de novo (opcional).
- Alineamiento de lecturas frente a secuencias de referencia.
- Cuantificación de la expresión génica de la muestra.
- Análisis de la expresión génica diferencial entre distintas muestras.
- Estudio de enriquecimiento de ontologías génicas y pathways.
- Estudio de isoformas generadas en eventos de splicing alternativo*.
- Análisis de genes de fusión*.
- Detección de variantes de calidad (SNVs e InDels) y filtrado de variantes habituales en la población*.
- Identificación de otros RNAs (smallRNAs y ncRNA)*.
*Cuando el diseño del experimento y la cobertura lo permitan.
Visualización de Resultados
El informe de resultados se entrega a través de nuestra plataforma web Genome one Reports para que puedas llevar a cabo la visualización y revisión de los mismos. Toda la información se representa en tablas interactivas y gráficos fácilmente interpretables y exportables en formatos adecuados para su uso en publicaciones científicas.
A través de Genome one Reports tendrás acceso a:
- Análisis de calidad de las secuencias obtenidas.
- Análisis de correlación de muestras y estudio diferencial de expresión:
- PCA Plot
- Adjusted p-value histogram
- MA plot
- Volcano Plot
- Heatmap
- Correlation Heatmap
- Enriquecimiento de rutas y términos Gene Ontologies:
- WikiPathways
- GO-MF
- GO-CC
- GO-BP
Además, ofrecemos la posibilidad de integrar resultados de diferentes análisis transcriptómicos (mRNAs, miRNAs, lncRNAs, etc).
Ejemplo de visualización de los resultados a través de nuestra plataforma Genome one Reports.
El RNA-Seq será de gran ayuda en la práctica clínica
Aunque el análisis de RNA-Seq aún no se está usando de forma sistemática en la práctica clínica los datos procedentes del estudio del transcriptoma en diferentes tejidos pueden facilitar la identificación de variantes, genes, rutas metabólicas y cascadas de señalización implicados en diferentes patologías.
El RNA-Seq será de gran ayuda en la práctica clínica
Aunque el análisis de RNA-Seq aún no se está usando de forma sistemática en la práctica clínica los datos procedentes del estudio del transcriptoma en diferentes tejidos pueden facilitar la identificación de variantes, genes, rutas metabólicas y cascadas de señalización implicados en diferentes patologías.
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