Servicios Bioinformáticos

La principal misión de DREAMgenics es poner a disposición de los profesionales clínicos e investigadores datos genómicos de alta calidad en un tiempo reducido. Para ello, ofrecemos servicios bioinformáticos integrales que incluyen asesoramiento, secuenciación, análisis y explotación de datos.

Contamos con un equipo de profesionales con un conocimiento profundo de las tecnologías genómicas, amplia experiencia en el análisis bioinformático, desarrollo de software y gestión de recursos computacionales.

Usando nuestros servicios, conseguirá reducir al mínimo la inversión económica en infraestructura  informática y en personal y acortar los tiempos necesarios para el análisis.

Entre nuestros clientes contamos con hospitales, universidades, centros I+D, empresas biotecnológicas y farmacéuticas nacionales e internacionales.

Metodología

Servicios Bioinformáticos | DREAMgenics
Asesoramiento bioinformático | DREAMgenics

En DREAMgenics consideramos fundamental conocer sus necesidades para con el objetivo de obtener los mejores resultados. Para conseguirlo, nuestro equipo de expertos ofrece un servicio de asesoramiento completamente personalizado, tanto en cuestiones científicas como técnicas, durante todo el proceso.

Secuenciacion | DREAMgenics

Nuestra colaboración con los proveedores de secuenciación más prestigiosos nos pemite seleccionar la plataforma idónea para su proyecto. Además, le ayudaremos en la elección, preparación y controles de calidad de la muestra.

Analisis bioinformatico | DREAMgenics

Una vez secuenciada la muestra, llevaremos a cabo el análisis e interpretación de los datos. Las herramientas bioinformáticas desarrolladas por DREAMgenics permiten adaptarse a sus necesidades e integrar sus propios algoritmos, pipelines, bases de datos, etc.

Informe de resultados | DREAMgenics

La excelente sensibilidad y especificidad de nuestros análisis permiten identificar variantes genómicas de alta calidad, extraer toda la información biológica relevante y reducir los gastos asociados a su validación. Los resultados serán entregados mediante un informe detallado.

DG Reports | DREAMgenics

Además, ofrecemos la posibilidad de visualización avanzada y revisión interactiva de los resultados a través de nuestra exclusiva plataforma DG Reports.

Características:

• Filtrado y priorización de variantes

• Preclasificación de variantes

• Interfaz gráfica (navegador genómico)

• Estadísticas y controles de calidad

• Información exportable

• Generación automatizada de informes

Nuestros Análisis

Ofrecemos servicios de análisis bioinformático de datos genómicos y transcriptómicos procedentes de tecnologías de secuenciación masiva (Next Generation SequencingNGS).

Análisis Bioinformático de Genomas Completos

 

El análisis de un genoma completo incluye:

• Preprocesamiento y controles de calidad de la secuencia.

• Ensamblaje de novo (opcional)

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Filtrado de los datos y controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de variantes germinales de alta calidad (SNVs, InDels, SVs, CNVs)

• Marcado de polimorfismos habituales en la población.

  • Anotación de las variantes obtenidas con base de datos de mutaciones patológicas y de predicción del efecto funcional de las variantes obtenidas.
  • Comparación entre muestras y extracción de variantes recurrentes.

• Generación de informe final para el cliente.

• Acceso a DG Reports.

Análisis Bioinformático de Exomas Completos

 

El análisis de un exoma completo incluye:

• Preprocesamiento y controles de calidad de la secuencia.

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Filtrado de los datos y controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de variantes germinales de alta calidad (SNVs, InDels, SVs, CNVs)

• Marcado de polimorfismos habituales en la población.

• Anotación de las variantes obtenidas con base de datos de mutaciones patológicas y de predicción del efecto funcional de las variantes obtenidas.

• Comparación entre muestras y extracción de variantes recurrentes.

• Generación de informe final para el cliente.

• Acceso a DG Reports.

Análisis Bioinformático de Transcriptomas

 

El análisis de muestras procedentes de RNA-Seq incluye:

• Preprocesamiento y controles de calidad de la secuencia.

• Ensamblaje de novo (opcional)

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Estudio de la expresión génica de la muestra

• Estudio de la expresión génica diferencial entre las distintas muestras del estudio.

• Análisis de enriquecimiento de ontologías génicas y pathways.

• Estudio de nuevos transcritos y de eventos de splicing alternativo*.

• Estudio de genes de fusión*.

• Detección de variantes germinales de alta calidad (SNVs e InDels)*.

• Marcado de polimorfismos habituales en la población.*

• Generación de informe final para el cliente.

 

* Cuando el diseño del experimento y la cobertura lo permita.

Diseño y Análisis Bioinformático de Paneles de Genes y/o regiones de interés

 

• Diseño del panel y/o regiones de interés (opcional).

El análisis de un panel de genes y/o de regiones de interés incluye:

• Preprocesamiento y controles de calidad de la secuencia.

• Filtrado de los datos y controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de variantes germinales de alta calidad (SNVs, InDels, SVs, CNVs)

• Marcado de polimorfismos habituales en la población.

• Anotación de las variantes obtenidas con base de datos de mutaciones patológicas y de predicción del efecto funcional de las variantes obtenidas.

• Comparación entre muestras y extracción de variantes recurrentes.

• Generación de informe final para el cliente.

• Acceso a DG Reports.

Análisis Bioinformático de ChIP-Seq

 

El análisis de muestras procedentes de ChIP-Seq incluye:

• Preprocesamiento y controles de calidad de la secuencia.

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Filtrado de los datos, eliminación de lecturas de baja calidad y de lecturas alineadas incorrectamente.

• Controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de los sitios de unión de factores de transcripción, e identificación de los genes relacionados con estas secuencias.

• Screening de sitios consenso conocidos y descubrimiento de sitios consenso “de novo”.

• Comparación entre muestras.

• Generación de informe final para el cliente.

Análisis Bioinformático de ATAC-Seq

 

El análisis de muestras procedentes de ATAC-Seq incluye:

• Preprocesamiento y controles de calidad de la secuencia.

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Filtrado de los datos, eliminación de lecturas de baja calidad y de lecturas alineadas incorrectamente.

• Controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de los sitios de unión de factores de transcripción, e identificación de los genes relacionados con estas secuencias.

• Screening de sitios consenso conocidos y descubrimiento de sitios consenso “de novo”.

• Comparación entre muestras.

• Generación de informe final para el cliente.

Además ofrecemos la posibilidad de realizar:

Análisis genómicos | DREAMgenics

Tumor / Normal

Análisis de trios | DREAMgenics

Análisis de Tríos

estudios familiares | DREAMgenics

Estudios Familiares

especies | DREAMgenics

Multiespecies

Si desea realizar otro tipo de servicio bioinformático y no lo encuentra en nuestra web, consúltenos a través del formulario de contacto.

Los análisis bioinformáticos realizados con nuestro software HD Genome One cumplen con los requisitos necesarios referentes al marcado CE-IVD.

Nuestros análisis y metodología están avalados por publicaciones en las revistas científicas internacionales más prestigiosas.

Todos nuestros procedimientos cumplen con los requerimientos marcados por el nuevo Reglamento General de Protección de Datos.

 

Metodología

Asesoramiento bioinformático | DREAMgenics

En DREAMgenics consideramos fundamental conocer sus necesidades para poder obtener los mejores resultados. Para conseguirlo, nuestro equipo de expertos ofrece un servicio de asesoramiento completamente personalizado, tanto en cuestiones científicas como técnicas, durante todo el proceso.

Secuenciacion | DREAMgenics

Nuestra colaboración con los proveedores de secuenciación más prestigiosos permitirá seleccionar la plataforma que más adecuada para su proyecto. Además, le ayudaremos en la elección, preparación y controles de calidad de la muestra.

Analisis bioinformatico | DREAMgenics

Una vez secuenciada la muestra, llevaremos a cabo el análisis e interpretación de los datos. Las herramientas bioinformáticas desarrolladas por DREAMgenics permiten adaptarse a sus necesidades e integrar sus propios algoritmos, pipelines, bases de datos…

Informe de resultados | DREAMgenics

La alta sensibilidad y especificidad de nuestros análisis permiten identificar variantes genómicas de alta calidad, extraer toda la información biológica relevante y reducir los gastos asociados a su validación. Los resultados serán entregados mediante un detallado informe.

DG Reports | DREAMgenics

Ofrecemos la posibilidad de visualización avanzada y revisión interactiva de los resultados a través de nuestra plataforma DG Reports. Características:

• Filtrado y priorización de variantes

• Preclasificación de variantes

• Interfaz gráfica (navegador genómico)

• Estadísticas y controles de calidad

• Información exportable

• Generación automatizada de informes

Nuestros Análisis

Ofrecemos servicios de análisis bioinformático de datos genómicos y transcriptómicos procedentes de tecnologías de secuenciación NGS.

Análisis Bioinformático de Genomas Completos

 

El análisis de un genoma completo incluye:

• Preprocesamiento y controles de calidad de la secuencia.

• Ensamblaje de novo (opcional)

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Filtrado de los datos y controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de variantes germinales de alta calidad (SNVs, InDels, SVs, CNVs)

• Marcado de polimorfismos habituales en la población.

  • Anotación de las variantes obtenidas con base de datos de mutaciones patológicas y de predicción del efecto funcional de las variantes obtenidas.
  • Comparación entre muestras y extracción de variantes recurrentes.

• Generación de informe final para el cliente.

• Acceso a DG Reports.

Análisis Bioinformático de Exomas Completos

 

El análisis de un exoma completo incluye:

• Preprocesamiento y controles de calidad de la secuencia.

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Filtrado de los datos y controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de variantes germinales de alta calidad (SNVs, InDels, SVs, CNVs)

• Marcado de polimorfismos habituales en la población.

• Anotación de las variantes obtenidas con base de datos de mutaciones patológicas y de predicción del efecto funcional de las variantes obtenidas.

• Comparación entre muestras y extracción de variantes recurrentes.

• Generación de informe final para el cliente.

• Acceso a DG Reports.

Análisis Bioinformático de Transcriptomas

 

El análisis de muestras procedentes de RNA-Seq incluye:

• Preprocesamiento y controles de calidad de la secuencia.

• Ensamblaje de novo (opcional)

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Estudio de la expresión génica de la muestra

• Estudio de la expresión génica diferencial entre las distintas muestras del estudio.

• Análisis de enriquecimiento de ontologías génicas y pathways.

• Estudio de nuevos transcritos y de eventos de splicing alternativo*.

• Estudio de genes de fusión*.

• Detección de variantes germinales de alta calidad (SNVs e InDels)*.

• Marcado de polimorfismos habituales en la población.*

• Generación de informe final para el cliente.

 

* Cuando el diseño del experimento y la cobertura lo permita.

Diseño y Análisis Bioinformático de Paneles de Genes y/o regiones de interés

 

• Diseño del panel y/o regiones de interés (opcional).

El análisis de un panel de genes y/o de regiones de interés incluye:

• Preprocesamiento y controles de calidad de la secuencia.

• Filtrado de los datos y controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de variantes germinales de alta calidad (SNVs, InDels, SVs, CNVs)

• Marcado de polimorfismos habituales en la población.

• Anotación de las variantes obtenidas con base de datos de mutaciones patológicas y de predicción del efecto funcional de las variantes obtenidas.

• Comparación entre muestras y extracción de variantes recurrentes.

• Generación de informe final para el cliente.

• Acceso a DG Reports.

Análisis Bioinformático de ChIP-Seq

 

El análisis de muestras procedentes de ChIP-Seq incluye:

• Preprocesamiento y controles de calidad de la secuencia.

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Filtrado de los datos, eliminación de lecturas de baja calidad y de lecturas alineadas incorrectamente.

• Controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de los sitios de unión de factores de transcripción, e identificación de los genes relacionados con estas secuencias.

• Screening de sitios consenso conocidos y descubrimiento de sitios consenso “de novo”.

• Comparación entre muestras.

• Generación de informe final para el cliente.

Análisis Bioinformático de ATAC-Seq

 

El análisis de muestras procedentes de ATAC-Seq incluye:

• Preprocesamiento y controles de calidad de la secuencia.

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Filtrado de los datos, eliminación de lecturas de baja calidad y de lecturas alineadas incorrectamente.

• Controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de los sitios de unión de factores de transcripción, e identificación de los genes relacionados con estas secuencias.

• Screening de sitios consenso conocidos y descubrimiento de sitios consenso “de novo”.

• Comparación entre muestras.

• Generación de informe final para el cliente.

Además ofrecemos la posibilidad de realizar:

Análisis genómicos | DREAMgenics

Tumor / Normal

Análisis de trios | DREAMgenics

Análisis de Tríos

estudios familiares | DREAMgenics

Estudios Familiares

especies | DREAMgenics

Multiespeciesmulties

Si desea realizar otro tipo de servicio bioinformático y no lo encuentra en nuestra web, consúltenos a través del formulario de contacto.

Los análisis bioinformáticos realizados con nuestro software HD Genome One cumplen con los requisitos necesarios referentes al marcado CE-IVD.

Nuestros análisis y metodología están avalados por publicaciones en las revistas científicas internacionales más prestigiosas.

Todos nuestros procedimientos cumplen con los requerimientos marcados por el nuevo Reglamento General de Protección de Datos.

 

Estoy interesad@ en los Servicios Bioinformáticos

Déjenos sus datos a través del formulario y nos pondremos en contacto usted.

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