Análisis Metagenómicos

La metagenómica permite la caracterización y cuantificación de las comunidades microbianas presentes en una muestra. Esta información tiene múltiples aplicaciones clínicas, biotecnológicas y medioambiantales. Además, para obtener los mejores resultados, en DREAMgenics ofrecemos un asesoramiento completamente personalizado, tanto en cuestiones científicas como técnicas.

A partir de datos procedentes de secuenciación de regiones variables 16S o shotgun (tecnologías Illumina o Ion Torrent) llevamos a cabo análisis metagenómicos que incluyen:

  • Filtrado de datos y controles estadísticos de calidad de las secuencias.
  • Anotación basada en asignación de OTUs (Operational Taxonomic Unit).
  • Cálculo de la alfa y beta diversidad.
  • Clasificación taxonómica y análisis diferencial.
  • Predicción de la contribución en rutas biológicas y metabólicas.

Visualización de Resultados

El informe de resultados se entrega a través de nuestra plataforma web genome one reports para que puedas llevar a cabo la visualización y revisión de los mismos. Toda la información se representa en tablas interactivas y gráficos fácilmente interpretables y exportables en formatos adecuados para su uso en publicaciones científicas.

A través de genome one reports tendrás acceso a los datos de:

  • Análisis de calidad de las secuencias obtenidas.
  • Análisis de alfa diversidad (OTUs, Shannon Index, Faith’s Phylgenetic Diversity).
  • Análisis de beta diversidad (Bray Curtis Index, Jaccard Index, UNIFRAC Weighted Index, UNIFRAC Unweighted Index).
  • Clasificación taxonómica y análisis diferencial (taxonomic barplots, percentajes, differential analysis, differential analysis plot).
  • Predicción del impacto metabólico (pathway enrichment plot and pathway enrichment table).

Análisis Metagenómicos

La metagenómica permite la caracterización y cuantificación de las comunidades microbianas presentes en una muestra. Esta información tiene múltiples aplicaciones clínicas, biotecnológicas y medioambiantales. Además, para obtener los mejores resultados, en DREAMgenics ofrecemos un asesoramiento completamente personalizado, tanto en cuestiones científicas como técnicas.

A partir de datos procedentes de secuenciación de regiones variables 16S o shotgun (tecnologías Illumina o Ion Torrent) llevamos a cabo análisis metagenómicos que incluyen:

  • Filtrado de datos y controles estadísticos de calidad de las secuencias.
  • Anotación basada en asignación de OTUs (Operational Taxonomic Unit).
  • Cálculo de la alfa y beta diversidad.
  • Clasificación taxonómica y análisis diferencial.
  • Predicción de la contribución en rutas biológicas y metabólicas.

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  • Clasificación taxonómica y análisis diferencial (taxonomic barplots, percentajes, differential analysis, differential analysis plot).
  • Predicción del impacto metabólico (pathway enrichment plot and pathway enrichment table).

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