Análisis transcriptómicos

 

El análisis de RNA-Seq permite cuantificar la expresión génica mediante el uso de plataformas NGS. La interpretación de los datos procedentes de esta tecnología se ha convertido en un servicio cada vez más demandado debido a su sensibilidad y precisión.
En DREAMgenics poseemos una amplia experiencia en el análisis bioinformático de RNA-Seq de múltiples especies. Además, ofrecemos un servicio de asesoramiento completamente personalizado tanto en el diseño experimental como en el análisis de datos y la interpretación de resultados.

El servicio de análisis incluye:

• Control de calidad de las secuencias.
• Ensamblaje de novo (opcional).
• Alineamiento de lecturas frente a secuencias de referencia.
• Cuantificación de la expresión génica de la muestra.
• Análisis de la expresión génica diferencial entre distintas muestras.
• Estudio de enriquecimiento de ontologías génicas y pathways.
• Estudio de isoformas generadas en eventos de splicing alternativo*.
• Análisis de genes de fusión*.
• Detección de variantes de calidad (SNVs e InDels) y filtrado de variantes habituales en la población*.
• Identificación de otros RNAs (smallRNAs y ncRNA)*.

* cuando el diseño del experimento y la cobertura lo permita.

 

Resultados

El informe de resultados se entrega a través de nuestra plataforma web genome one reports, que permite la visualización avanzada y la revisión interactiva de los mismos.
Los datos se representan en tablas y gráficos fácilmente interpretables. Además, toda la información es exportable en formatos adecuados para su uso en publicaciones científicas.

Nuestro software genome one, con el que llevamos a cabo los análisis bioinformáticos, cumple con los requisitos necesarios referentes al marcado CE-IVD y la UNE-EN ISO 13485:2016.

Análisis transcriptómicos

 

El análisis de RNA-Seq permite cuantificar la expresión génica mediante el uso de plataformas NGS. La interpretación de los datos procedentes de esta tecnología se ha convertido en un servicio cada vez más demandado debido a su sensibilidad y precisión.
En DREAMgenics poseemos una amplia experiencia en el análisis bioinformático de RNA-Seq de múltiples especies. Además, ofrecemos un servicio de asesoramiento completamente personalizado tanto en el diseño experimental como en el análisis de datos y la interpretación de resultados.

El servicio de análisis incluye:

• Control de calidad de las secuencias.
• Ensamblaje de novo (opcional).
• Alineamiento de lecturas frente a secuencias de referencia.
• Cuantificación de la expresión génica de la muestra.
• Análisis de la expresión génica diferencial entre distintas muestras.
• Estudio de enriquecimiento de ontologías génicas y pathways.
• Estudio de isoformas generadas en eventos de splicing alternativo*.
• Análisis de genes de fusión*.
• Detección de variantes de calidad (SNVs e InDels) y filtrado de variantes habituales en la población*.
• Identificación de otros RNAs (smallRNAs y ncRNA)*.

* cuando el diseño del experimento y la cobertura lo permita.

 

Resultados

El informe de resultados se entrega a través de nuestra plataforma web genome one reports, que permite la visualización avanzada y la revisión interactiva de los mismos.
Los datos se representan en tablas y gráficos fácilmente interpretables. Además, toda la información es exportable en formatos adecuados para su uso en publicaciones científicas.

Nuestro software genome one, con el que llevamos a cabo los análisis bioinformáticos, cumple con los requisitos necesarios referentes al marcado CE-IVD y la UNE-EN ISO 13485:2016.