Análisis transcriptómicos

Los análisis transcriptómicos permiten cuantificar la expresión génica mediante el uso de plataformas NGS. La interpretación de los datos procedentes de esta tecnología se ha convertido en un servicio cada vez más demandado debido a su sensibilidad y precisión.

El servicio de análisis incluye:

  • Control de calidad de las secuencias.
  • Ensamblaje de novo (opcional).
  • Alineamiento de lecturas frente a secuencias de referencia.
  • Cuantificación de la expresión génica de la muestra.
  • Análisis de la expresión génica diferencial entre distintas muestras.
  • Estudio de enriquecimiento de ontologías génicas y pathways.
  • Estudio de isoformas generadas en eventos de splicing alternativo*.
  • Análisis de genes de fusión*.
  • Detección de variantes de calidad (SNVs e InDels) y filtrado de variantes habituales en la población*.
  • Identificación de otros RNAs (smallRNAs y ncRNA)*.

*Cuando el diseño del experimento y la cobertura lo permitan.

Visualización de Resultados

El informe de resultados se entrega a través de nuestra plataforma web genome one reports para que puedas llevar a cabo la visualización y revisión de los mismos. Toda la información se representa en tablas interactivas y gráficos fácilmente interpretables y exportables en formatos adecuados para su uso en publicaciones científicas.

A través de genoma one reports tendrás acceso a los datos de:

  • Análisis de calidad de las secuencias obtenidas para cada una de las muestras.
  • Análisis de correlación de muestras y estudio diferencial de expresión (PCA Plot, Adjusted p-value histogram, MA plot, Volcano Plot, Heatmap, Correlation Heatmap).
  • Enriquecimiento de rutas y términos Gene Ontologies (KEGG, GO-MF, GO-CC Y GO-BP).

Además, te ofrecemos la posibilidad de integrar resultados de diferentes análisis transcriptómicos (mRNAs, miRNAs, lncRNAs, etc).

Análisis Transcriptómicos

Los análisis transcriptómicos permiten cuantificar la expresión génica mediante el uso de plataformas NGS. La interpretación de los datos procedentes de esta tecnología se ha convertido en un servicio cada vez más demandado debido a su sensibilidad y precisión.

En DREAMgenics poseemos una amplia experiencia en el análisis bioinformático de RNA-Seq de múltiples especies. Además, ofrecemos un servicio de asesoramiento completamente personalizado tanto en el diseño experimental como en el análisis de datos y la interpretación de resultados.

El servicio de análisis incluye:

  • Control de calidad de las secuencias.
  • Ensamblaje de novo (opcional).
  • Alineamiento de lecturas frente a secuencias de referencia.
  • Cuantificación de la expresión génica de la muestra.
  • Análisis de la expresión génica diferencial entre distintas muestras.
  • Estudio de enriquecimiento de ontologías génicas y pathways.
  • Estudio de isoformas generadas en eventos de splicing alternativo*.
  • Análisis de genes de fusión*.
  • Detección de variantes de calidad (SNVs e InDels) y filtrado de variantes habituales en la población*.
  • Identificación de otros RNAs (smallRNAs y ncRNA)*.

*Cuando el diseño del experimento y la cobertura lo permitan.

Visualización de Resultados

El informe de resultados se entrega a través de nuestra plataforma web genome one reports para que puedas llevar a cabo la visualización y revisión de los mismos. Toda la información se representa en tablas interactivas y gráficos fácilmente interpretables y exportables en formatos adecuados para su uso en publicaciones científicas.

A través de genoma one reports tendrás acceso a los datos de:

  • Análisis de calidad de las secuencias obtenidas para cada una de las muestras.
  • Análisis de correlación de muestras y estudio diferencial de expresión (PCA Plot, Adjusted p-value histogram, MA plot, Volcano Plot, Heatmap, Correlation Heatmap).
  • Enriquecimiento de rutas y términos Gene Ontologies (KEGG, GO-MF, GO-CC Y GO-BP).

Además, te ofrecemos la posibilidad de integrar resultados de diferentes análisis transcriptómicos (mRNAs, miRNAs, lncRNAs, etc).

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