Servicios Bioinformáticos

Somos expertos en análisis bioinformáticos de datos genómicos, transcriptómicos y metagenómicos procedentes de tecnologías Next-generation Sequencing .

Además, contamos con herramientas bioinformáticas propias que proporcionan datos de alta calidad adaptados a las necesidades de cada cliente.

Nuestros servicios bioinformáticos integrales incluyen asesoramiento, secuenciación, análisis y explotación de datos.

servicios-bioinoformaticos
asesoramiento

En DREAMgenics consideramos fundamental conocer sus necesidades para obtener los mejores resultados. Para conseguirlo, nuestro equipo de expertos ofrece un servicio de asesoramiento completamente personalizado, tanto en cuestiones científicas como técnicas, durante todo el proceso.

secuenciacion

Nuestra colaboración con los proveedores de secuenciación más prestigiosos nos permite seleccionar la plataforma idónea para su proyecto. Además, le ayudaremos en la elección, preparación y controles de calidad de la muestra.

analisis-de-datos

Una vez secuenciada la muestra, llevaremos a cabo el análisis e interpretación de los datos. Las herramientas bioinformáticas desarrolladas por DREAMgenics permiten adaptarse a sus necesidades e integrar sus propios algoritmos, pipelines, bases de datos, etc.

informe-de-resultados

La excelente sensibilidad y especificidad de nuestros análisis permiten identificar variantes genómicas de alta calidad, extraer toda la información biológica relevante y reducir los gastos asociados a su validación. Los resultados serán entregados mediante un informe detallado.

genome-one-reports

Además, ofrecemos la posibilidad de visualización avanzada y revisión interactiva de los resultados a través de nuestra exclusiva plataforma DG Reports.

Análisis Bioinformático de Genomas Completos

 

El análisis de un genoma completo incluye:

• Control de calidad de las secuencias.

• Ensamblaje de novo (opcional)

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencias de referencia.

• Detección de variantes de alta calidad (SVs, SNVs y CNVs).

• Filtrado de variantes habituales en la población.

• Anotación de las variantes obtenidas con múltiples bases de datos y algoritmos de predicción.

• Comparación entre muestras y extracción de variantes recurrentes.

• Generación de informe final  y acceso a DG Reports.

Análisis Bioinformático de Exomas Completos

 

El análisis de un exoma completo incluye:

• Control de calidad de las secuencias.

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Detección de variantes de alta calidad (SVs, SNVs y CNVs).

• Filtrado de variantes habituales en la población.

• Anotación de las variantes obtenidas con múltiples bases de datos y algoritmos de predicción.

• Comparación entre muestras y extracción de variantes recurrentes.

• Generación de informe final  y acceso a DG Reports.

Diseño y Análisis Bioinformático de Paneles de Genes y/o regiones genómicas de interés

 

Diseño del panel y/o regiones de interés (opcional).

El análisis de un panel de genes y/o de regiones de interés incluye:

• Control de calidad de las secuencias.

• Alineamiento de lecturas frente a secuencias de referencia

• Detección de variantes de alta calidad (SVs, SNVs y CNVs).

• Filtrado de variantes habituales en la población.

• Anotación de las variantes obtenidas con múltiples bases de datos y algoritmos de predicción.

• Comparación entre muestras y extracción de variantes recurrentes.

• Generación de informe final  y acceso a DG Reports.

Análisis Bioinformático de ChIP-Seq

 

El análisis de muestras procedentes de ChIP-Seq incluye:

• Control de calidad de las secuencias.

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de los sitios de unión de factores de transcripción, e identificación de los genes relacionados con estas secuencias.

• Screening de sitios consenso conocidos y descubrimiento de sitios consenso “de novo”.

• Comparación entre muestras.

• Generación de informe final para el cliente.

Análisis Bioinformático de ATAC-Seq

 

El análisis de muestras procedentes de ATAC-Seq incluye:

• Control de calidad de las secuencias.

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de los sitios de unión de factores de transcripción, e identificación de los genes relacionados con estas secuencias.

• Screening de sitios consenso conocidos y descubrimiento de sitios consenso “de novo”.

• Comparación entre muestras.

• Generación de informe final para el cliente.

Análisis Bioinformático de Transcriptoma

 

El análisis de muestras procedentes de RNA-Seq incluye:

• Control de calidad de las secuencias.

• Ensamblaje de novo (opcional).

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Cuantificación de la expresión génica de la muestra

• Análisis de la expresión génica diferencial entre las distintas muestras del estudio.

• Estudio de enriquecimiento de ontologías génicas y pathways.

• Estudio de nuevos transcritos y de eventos de splicing alternativo*.

• Análisis de genes de fusión*.

• Detección de variantes de alta calidad (SNVs e InDels)*.

• Filtrado de variantes habituales en la población.*

• Identificación y cuantificación de otros RNAs (smallRNAs, y ncRNAs)*

• Generación de informe final para el cliente a través de nuestra plataforma DG Reports.

   * Cuando el diseño del experimento y la cobertura lo permita.

Análisis Bioinformático de Metagenoma

 

El análisis de metagenoma incluye:

• Secuenciación de regiones variables 16S o shotgun (tecnologías Illumina e Ion Torrent).

• Filtrado de datos y controles estadísticos de calidad de las secuencias.

• Asignación de OTUs (Operational Taxonomic Unit).

• Cálculo de la alfa y beta diversidad.

• Clasificación taxonómica y análisis diferencial.

• Predicción de la contribución en rutas biológicas y metabólicas.

• Generación de informe final a través de la plataforma DG Reports.

Además,ofrecemos la posibilidad de realizar:

  • – Análisis de mutaciones somáticas en cáncer.
  • – Análisis de tríos/cohortes/pedigríes.
  • – Integración con análisis RNA-Seq.

 

Nuestro software genome one, con el que llevamos a cabo los análisis bioinformáticos, cumple con los requisitos necesarios referentes al marcado CE-IVD y la UNE-EN ISO 13485:2016.

asesoramiento

En DREAMgenics consideramos fundamental conocer sus necesidades para poder obtener los mejores resultados. Para conseguirlo, nuestro equipo de expertos ofrece un servicio de asesoramiento completamente personalizado, tanto en cuestiones científicas como técnicas, durante todo el proceso.

secuenciacion

Nuestra colaboración con los proveedores de secuenciación más prestigiosos permitirá seleccionar la plataforma que más adecuada para su proyecto. Además, le ayudaremos en la elección, preparación y controles de calidad de la muestra.

analisis-de-datos

Una vez secuenciada la muestra, llevaremos a cabo el análisis e interpretación de los datos. Las herramientas bioinformáticas desarrolladas por DREAMgenics permiten adaptarse a sus necesidades e integrar sus propios algoritmos, pipelines, bases de datos…

informe-de-resultados

La alta sensibilidad y especificidad de nuestros análisis permiten identificar variantes genómicas de alta calidad, extraer toda la información biológica relevante y reducir los gastos asociados a su validación. Los resultados serán entregados mediante un detallado informe.

genome-one-reports

Ofrecemos la posibilidad de visualización avanzada y revisión interactiva de los resultados a través de nuestra plataforma DG Reports.

Análisis Bioinformático de Genomas Completos

 

El análisis de un genoma completo incluye:

• Control de calidad de las secuencias.

• Ensamblaje de novo (opcional)

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencias de referencia.

• Detección de variantes de alta calidad (SVs, SNVs y CNVs).

• Filtrado de variantes habituales en la población.

• Anotación de las variantes obtenidas con múltiples bases de datos y algoritmos de predicción.

• Comparación entre muestras y extracción de variantes recurrentes.

• Generación de informe final  y acceso a DG Reports.

Análisis Bioinformático de Exomas Completos

 

El análisis de un exoma completo incluye:

• Control de calidad de las secuencias.

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Detección de variantes de alta calidad (SVs, SNVs y CNVs).

• Filtrado de variantes habituales en la población.

• Anotación de las variantes obtenidas con múltiples bases de datos y algoritmos de predicción.

• Comparación entre muestras y extracción de variantes recurrentes.

• Generación de informe final  y acceso a DG Reports.

Diseño y Análisis Bioinformático de Paneles de Genes y/o regiones genómicas de interés

 

Diseño del panel y/o regiones de interés (opcional).

El análisis de un panel de genes y/o de regiones de interés incluye:

• Control de calidad de las secuencias.

• Alineamiento de lecturas frente a secuencias de referencia

• Detección de variantes de alta calidad (SVs, SNVs y CNVs).

• Filtrado de variantes habituales en la población.

• Anotación de las variantes obtenidas con múltiples bases de datos y algoritmos de predicción.

• Comparación entre muestras y extracción de variantes recurrentes.

• Generación de informe final  y acceso a DG Reports.

Análisis Bioinformático de ChIP-Seq

 

El análisis de muestras procedentes de ChIP-Seq incluye:

• Control de calidad de las secuencias.

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de los sitios de unión de factores de transcripción, e identificación de los genes relacionados con estas secuencias.

• Screening de sitios consenso conocidos y descubrimiento de sitios consenso “de novo”.

• Comparación entre muestras.

• Generación de informe final para el cliente.

Análisis Bioinformático de ATAC-Seq

 

El análisis de muestras procedentes de ATAC-Seq incluye:

• Control de calidad de las secuencias.

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Controles estadísticos de la calidad de la secuenciación y del alineamiento.

• Detección de los sitios de unión de factores de transcripción, e identificación de los genes relacionados con estas secuencias.

• Screening de sitios consenso conocidos y descubrimiento de sitios consenso “de novo”.

• Comparación entre muestras.

• Generación de informe final para el cliente.

Análisis Bioinformático de Transcriptoma

 

El análisis de muestras procedentes de RNA-Seq incluye:

• Control de calidad de las secuencias.

• Ensamblaje de novo (opcional).

• Alineamiento de lecturas originadas frente a secuencia de referencia.

• Cuantificación de la expresión génica de la muestra

• Análisis de la expresión génica diferencial entre las distintas muestras del estudio.

• Estudio de enriquecimiento de ontologías génicas y pathways.

• Estudio de nuevos transcritos y de eventos de splicing alternativo*.

• Análisis de genes de fusión*.

• Detección de variantes de alta calidad (SNVs e InDels)*.

• Filtrado de variantes habituales en la población.*

• Identificación y cuantificación de otros RNAs (smallRNAs, y ncRNAs)*

• Generación de informe final para el cliente a través de nuestra plataforma DG Reports.

   * Cuando el diseño del experimento y la cobertura lo permita.

Análisis Bioinformático de Metagenoma

 

El análisis de metagenoma incluye:

• Secuenciación de regiones variables 16S o shotgun (tecnologías Illumina e Ion Torrent).

• Filtrado de datos y controles estadísticos de calidad de las secuencias.

• Asignación de OTUs (Operational Taxonomic Unit).

• Cálculo de la alfa y beta diversidad.

• Clasificación taxonómica y análisis diferencial.

• Predicción de la contribución en rutas biológicas y metabólicas.

• Generación de informe final a través de la plataforma DG Reports.

Además, ofrecemos la posibilidad de realizar:

  • – Análisis de mutaciones somáticas en cáncer.
  • – Análisis de tríos/cohortes/pedigríes.
  • – Integración con análisis RNA-Seq.

Nuestro software genome one, con el que llevamos a cabo los análisis bioinformáticos, cumple con los requisitos necesarios referentes al marcado CE-IVD y la UNE-EN ISO 13485:2016.