Spatial Transcriptomics
Ofrecemos el análisis de la actividad transcripcional en secciones de tejido
Estudio de la expresión génica en cortes histológicos
El flujo de análisis espacial, paso a paso
La técnica Spatial Transcriptomics mide la expresión génica sin perder su localización en el tejido, vinculando estructura y actividad celular.
Control de calidad de la secuenciación y mapeado.
Alineamiento de lecturas frente al genoma de referencia.
Cuantificación de la expresión génica a nivel de célula única.
Reducción de la dimensionalidad de los datos.
Clustering o división de las células en distintos grupos y subgrupos.
Análisis de expresión génica diferencial, tanto global como espacial.
Estudio del patrón evolutivo o de maduración celular (trayectorias global y espacial).
Estudio de patrones de comunicación celular (Cell Chat).
Estudio de enriquecimiento, ontologías génicas y pathways.
Servicios Bioinformáticos
RESULTADOS EN GENOME ONE REPORTS
Gráficos interactivos, listos para publicar
Los resultados de todos los análisis dan lugar a gráficos interactivos que se pueden explorar en nuestra plataforma Genome One Reports y descargarse en PDF para su uso en publicaciones científicas.
ANÁLISIS DISPONIBLES
Un paquete completo de análisis
Ofrecemos un paquete completo de análisis que entregamos a través de nuestra plataforma web Genome One Reports
Paquete ampliado
Completo- Cell Clustering (2D y 3D)
- Clustering espacial
- Genes diferencialmente expresados
- TOP genes diferencialmente expresados
- TOP genes diferencialmente expresados (espaciales)
- Análisis de trayectoria
- Análisis de trayectoria espacial
- Top 10 genes expresados (up & down) en una línea de trayectoria
- Contactos y comunicación intercelular (CellChat)
- Enriquecimiento de rutas (GSEA y términos GO)
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Centros e instituciones
Hospitales, universidades e institutos de investigación en Europa y Latinoamérica.
¿Hablamos de tu proyecto de spatial?
Te ayudamos a diseñar tu experimento y a interpretar la expresión génica en su contexto espacial. Cuéntanos qué necesitas