Transcriptómica

Análisis Transcriptómicos

La importancia de la expresión génica en el estudio de diferentes enfermedades

El desafío de conocer la expresión génica

Los análisis transcriptómicos permiten cuantificar la expresión génica mediante el uso de plataformas NGS. La interpretación de los datos procedentes de la secuenciación del ARN (RNA-Seq) se ha convertido en un servicio cada vez más demandado debido a su sensibilidad y precisión.

Nuestro análisis bioinformático incluye:

  • Control de calidad de las secuencias.
  • Alineamiento de lecturas frente a secuencias de referencia.
  • Cuantificación de la expresión génica de la muestra.
  • Análisis de la expresión génica diferencial entre distintas muestras.
  • Estudio de enriquecimiento de ontologías génicas y pathways.
  • Estudio de isoformas generadas en eventos de splicing alternativo*.
  • Identificación de otros RNAs (smallRNAs y ncRNA)*.

*Cuando el diseño experimental y la cobertura lo permitan.

Documentación
Archivos aceptados

Podemos llevar a cabo el análisis bioinformático a partir de:

  • Illumina®: FASTQ

Puedes enviarnos tus archivos crudos en un disco duro o compartirlos a través de un FTP. Si tienes cualquier duda contacta con nosotros enviando un email a info@dreamgenics.com o llamando al número de teléfono 985 088 180 y te ayudaremos.

Resultados en Genome One Reports

Entregamos los resultados de nuestros análisis transcriptómicos a través de nuestra plataforma Genome One Reports. Una plataforma web sencilla e intuitiva que te aportará las siguientes ventajas:

PCA Plot
Adjusted P-value Histogram
MA Plot
Volcano Plot
Heatmap
Correlation Heatmap

Diferentes opciones en experimentos RNA-Seq

Las librerías utilizadas en un experimento RNA-Seq depende de la muestra de partida y del tipo de ARNs que se quieran estudiar.

Contacta con nosotros y te ayudaremos a elegir la mejor opción para tu proyecto.

mRNA-Seq
totalRNA-Seq

*Eliminación de ribosomal RNA y globin mRNA en muestras de sangre.