Análisis Transcriptómicos
La importancia de la expresión génica en el estudio de diferentes enfermedades
Cómo analizamos tus datos de RNA-Seq
Estudio de la expresión génica
Los análisis transcriptómicos permiten cuantificar la expresión génica mediante un flujo de análisis bioinformático estructurado en varias etapas clave para garantizar resultados fiables y biológicamente relevantes.
Control de calidad de las secuencias.
Alineamiento de lecturas frente a secuencias de referencia.
Cuantificación de la expresión génica de la muestra.
Análisis de la expresión génica diferencial con p-valor y con p-valor ajustado.
Estudio de enriquecimiento de ontologías génicas y pathways.
Estudio de isoformas generadas en eventos de splicing alternativo.*
Identificación de otros RNAs (smallRNAs y ncRNA).*
*Cuando el diseño experimental y la cobertura lo permitan.
Servicios Bioinformáticos
RESULTADOS EN GENOME ONE REPORTS
Explora la expresión génica de forma visual
Los resultados de todos los análisis dan lugar a gráficos interactivos que se pueden explorar en nuestra plataforma Genome One Reports y descargarse en PDF para su uso en publicaciones científicas.
OPCIONES DISPONIBLES
Elige tu experimento de RNA-Seq
La librería y las condiciones de secuenciación dependen de la muestra de partida y del tipo de ARN que quieras estudiar. Te ayudamos a elegir la mejor opción.
mRNA-Seq & Total RNA-Seq
RecomendadoTranscriptoma codificante y diferentes biotipos de RNA.
- Plataforma DNBSEQ™-G400 (IVD)
- Librería MGIEasy Fast RNA Library
- Análisis de mRNA / mRNA + biotipos de RNA
- >500 ng de RNA total con RIN > 7
- Profundidad recomendada: 40–60 M/muestra*
- Mínimo 3 muestras por condición
- Expresión diferencial, ontologías y pathways
- Resultados en Genome One Reports
miRNA-Seq
RNA pequeño regulador.
- Plataforma DNBSEQ™-G400 (IVD)
- Librería MGIEasy Small RNA Library
- Análisis de miRNA
- >500 ng de RNA total con RIN > 7
- Profundidad recomendada: 20 M/muestra
- Mínimo 3 muestras por condición
- Expresión diferencial, ontologías y pathways
- Resultados en Genome One Reports
*Para la secuenciación de Total RNA-Seq la depleción de RNA ribosomal se realiza con el kit MGIEasy rRNA Depletion V1.3. En el caso de muestras de sangre, la depleción de RNA ribosomal y mRNA de globinas se realiza con el kit MGIEasy rRNA & Globin Depletion V1.3. Para la secuenciación de mRNA-Seq la captura de mRNA se realiza con el kit de purificación de ARNm Dynabeads™ de Invitrogen.
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