RNA Sequencing

Ponemos a tu disposición diferentes opciones de secuenciación masiva para el estudio de la expresión génica

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Secuenciación de RNA

Ofrecemos el servicio de secuenciación de RNA mediante el uso de la tecnología DNBSEQ™. Los FASTQ generados se entregan a través del servidor de Dreamgenics o mediante un disco duro, en función del tamaño total de los archivos.

El análisis del transcriptoma permite cuantificar los niveles de expresión génica en un momento concreto y bajo unas determinadas condiciones experimentales. Estos patrones de expresión son responsables de las diferentes propiedades que presentan las células y los tejidos, por lo tanto, su estudio en diferentes poblaciones celulares proporciona un mayor entendimiento de los elementos funcionales del genoma.

La secuenciación RNA-Seq que llevamos a cabo en Dreamgenics incluye:

Seguimiento del proyecto con un miembro de nuestro equipo.
Posibilidad de extracción del RNA a partir de diferentes muestras biológicas.
Parámetros de secuenciación adaptados a las características del proyecto.
Controles de calidad de muestras, librerías y secuenciación.
Tiempo de entrega estimado 10-15 días laborables.
Posibilidad de llevar a cabo el análisis bioinformático posterior, si se desea.

Servicio de secuenciación NGS

Conoce más información sobre los diferentes servicios de secuenciación que ofrecemos en nuestro folleto

Etapas del servicio

01

Asesoramiento inicial

Te ayudamos a elegir las condiciones de secuenciación que mejor se adapten a tu proyecto

02

Recepción de muestras

Recibimos tus muestras en nuestro laboratorio y realizamos el control de calidad

03

Preparación de librerías

Llevamos a cabo la preparación automatizada de librerías y el control de calidad del producto obtenido

04

Secuenciación NGS

Realizamos la secuenciación según las condiciones elegidas y te entregamos los FASTQ mediante HDD o nuestro FTP

Opciones disponibles

Los parámetros de secuenciación pueden adaptarse a las preferencias del usuario y a las características de cada experimento. Igualmente, podemos llevar a cabo la extracción de RNA de diferentes muestras biológicas.

	Total RNA-Seq	mRNA-Seq	miRNA-Seq
Librería	MGIEasy Fast RNA Library	MGIEasy Fast RNA Library	MGIEasy Small RNA Library
Tipo de ibrería	Convencional Strand-specific	Convencional Strand-specific	Convencional
Preparación de librerías	Automatizada en robot MGISP-100 (IVD)	Automatizada en robot MGISP-100 (IVD)	Automatizada en robot MGISP-100 (IVD)
Output recomendado*	60 Mill. lecturas	40 Mill. lecturas	20 Mill. lecturas
Secuenciación recomendada	PE150	PE150	SE50/SE100
Calidad de secuenciación	Q30 >85% con PE150	Q30 >85% con PE150	Q30 >90% con SE50/SE100
Plataforma	DNBSEQ-G400 (IVD)	DNBSEQ-G400 (IVD)	DNBSEQ-G400 (IVD)
Plazo de entrega	10-15 días laborables	10-15 días laborables	10-15 días laborables

*El output depende del diseño experimental de cada proyecto. Contacta con nosotros y te ayudaremos a elegir las condiciones de secuenciación que mejor se adapten a tus necesidades.

Contacta con nuestro equipo

Si deseas solicitar presupuesto, o si tienes alguna pregunta que realizarnos, no dudes en ponerte en contacto con nosotros y te ayudaremos.

Muestras y condiciones de envío

	Total RNA-Seq	mRNA-Seq	miRNA-Seq
Especie	Humano, animal, planta y microorganismo	Humano, animal y planta	Humano, animal y planta
Muestra	Total RNA de sangre, saliva, tejido, FFPE, etc.	Total RNA de sangre, saliva, tejido, FFPE, etc.	Total RNA de sangre, saliva, tejido, FFPE, etc.
Input y calidad de las muestras	≥500 ng, RIN≥7 FFPE: ≥200 ng, DV200≥50%	≥500 ng, RIN≥7 FFPE: ≥200 ng, DV200≥50%	≥500 ng, RIN≥7
Pretratamiento*	Depleción de rRNA o rRNA + Globin mRNA	Captura de mRNA	–
Condiciones de envío	Hielo seco	Hielo seco	Hielo seco

*Para la secuenciación de Total RNA-Seq la depleción de RNA ribosomal se realiza con el kit MGIEasy rRNA Depletion V1.3. En el caso de muestras de sangre, la depleción de RNA ribosomal y mRNA de globinas se realiza con el kit MGIEasy rRNA & Globin Depletion V1.3. Para la secuenciación de mRNA-Seq la captura de mRNA se realiza con el kit de purificación de ARNm Dynabeads™ de Invitrogen.

Expertos en análisis bioinformático

Descubre cómo podemos ayudarte a sacar el máximo partido a tus datos NGS

Te invitamos a realizar una breve videollamada con nuestro equipo en la que te mostraremos las características de nuestra plataforma Genome One Reports y podrás conocer los diferentes análisis RNA-Seq que ofrecemos